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SNP分型办事

 

 

概述

 

    SNP(single nucleotide polymorphism)单核苷酸多态性。是指基因组程度上由单个核苷酸的变异所惹起的DNA序列多态性,在群体中的产生频率不小于1%。SNP包罗单个碱基的转换、颠换、拔出和缺失等,散布比力普遍,无数据表现占一切已知多态性的90%以上。SNP作是继RFLP (限定性片断长度多态性)和小卫星DNA反复序列、微卫星DNA反复序列后的第三代DNA程度遗传多态性标志。
      SNP现已普遍使用于基因组剖析、生物信息主动化检测、复杂和庞大疾病的遗传研讨及环球种族遗传学研讨等。

 


技能特点

 

 密度高  SNP在人类基因组的均匀密度估量为1\1000bp,在整个基因组的散布达3×106个,遗传间隔为2~3cM,密度比微卫星标志更高,可以在任何一个待研讨基因的外部或左近提供一系列标志

 遗传波动性   与微卫星等反复序列多态性标志相比,SNP具有更高的遗传波动性

 易完成剖析的主动化   SNP标志在人群中只要两种等位型(allele)。如许在检测时只需一个“+\-”或“全\无”的方法,而无须象检测限定性片断长度多态性,微卫星那样对片断的长度做出丈量,这使得基于SNP的检测剖析办法易完成主动化

 


间接测序法技能道路:

 

 

 


质谱法技能道路:

 

 

 


SNP分型办事送样要求

 

 DNA样品:浓度≥20ng/ul、体积≥20ul的总DNA样品

 血液样品:请提供≥500ul抗凝血;接纳尺度的采样管,抗凝剂保举利用EDTA

 构造样品:请提供足量的构造样品

 PCR产品:提供浓度≥20ng/ul、体积≥20ul(依据详细的实行位点而定)

 SNP位点信息:SNP位点的rs号;SNP位点上卑鄙各200bp确实切序列及SNP位点的渐变范例